Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 SCOC-203ENST00000394203 1999 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC01277-201ENST00000419957 2398 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL138900.3-201ENST00000607010 629 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
TPRNQ4KMQ1 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
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