Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 MTND4P28-201ENST00000426217 387 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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GEN1Q17RS7 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
GEN1Q17RS7 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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