Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC006116.3-201ENST00000592968 361 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 KCNJ16-204ENST00000585558 4014 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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RTN1Q16799 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
RTN1Q16799 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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