Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC024257.5-201ENST00000612739 531 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC104763.3-201ENST00000613765 618 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CDKN3Q16667 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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