Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL36AP10-201ENST00000421785 322 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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DDB1Q16531 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 BCRP9-201ENST00000605312 388 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
DDB1Q16531 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
DDB1Q16531 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
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