Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
GABRA6Q16445 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms