Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZC3H11A-202ENST00000367210 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SMAD5-AS1_4.1-201ENST00000615561 167 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL132989.1-201ENST00000557322 576 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
E2F4Q16254 RAB3B-201ENST00000371655 12844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
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