Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 NREP-207ENST00000450761 636 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC138057.1-201ENST00000497258 696 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL157402.2-201ENST00000566394 416 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
NEDD8Q15843 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.1 ms