Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02527-201ENST00000449069 762 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CLK1-203ENST00000409769 1192 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RBM7-208ENST00000545678 867 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
VAMP3Q15836 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
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