Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 STATH-201ENST00000246895 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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ALX1Q15699 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
ALX1Q15699 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
ALX1Q15699 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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