Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC090802.1-201ENST00000520870 445 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CACNB4-222ENST00000636350 7654 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 KCNH7-204ENST00000618399 3713 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CCDC7-207ENST00000535327 700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HERPUD1Q15011 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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