Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC006518.2-201ENST00000542513 940 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
GPNMBQ14956 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms