Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

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Length 915 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC008083.1-201ENST00000547748 663 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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SPIDRQ14159 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SPIDRQ14159 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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