Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TRIQK-204ENST00000517858 1882 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 NPY1R-204ENST00000509586 1017 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC1.96□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
CACNA1CQ13936 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC007336.1-201ENST00000576365 3828 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CACNA1CQ13936 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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