Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
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PKP1Q13835 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
PKP1Q13835 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
PKP1Q13835 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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