Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL450489.1-201ENST00000612071 468 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 R3HDM1-220ENST00000628915 4325 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms