Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CACNA1SQ13698 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
CACNA1SQ13698 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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