Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PRPF38AP1-201ENST00000451976 933 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL355802.3-201ENST00000607571 545 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ERCC6L-201ENST00000334463 4243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 CACNB4-221ENST00000636130 7748 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMAD4Q13485 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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