Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC016769.3-201ENST00000396562 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL159169.3-201ENST00000608871 561 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SNORA70.4-201ENST00000365509 134 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC109458.1-201ENST00000508858 316 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
SGCGQ13326 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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