Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC016987.2-201ENST00000560696 351 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RIGQ13278 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RPS27AP7-201ENST00000422792 455 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LRTOMT-215ENST00000538478 814 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RIGQ13278 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
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