Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC01153-201ENST00000429809 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 USP8-201ENST00000307179 4243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
TRIM28Q13263 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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