Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL158069.1-201ENST00000454131 455 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNU4-35P-201ENST00000362588 141 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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ERCC8Q13216 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
ERCC8Q13216 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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