Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZNF678-201ENST00000343776 8556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC004817.4-201ENST00000602396 3625 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 B3GALT2-201ENST00000367434 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
DUSP4Q13115 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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