Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PRKD3-202ENST00000379066 6111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC004865.1-201ENST00000442276 1003 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 DNM3-IT1-201ENST00000450800 396 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AC069157.1-201ENST00000421749 137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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TRAF1Q13077 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
TRAF1Q13077 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
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