Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 AC245452.5-201ENST00000620649 780 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
NFIAQ12857 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PPEF1-201ENST00000349874 2687 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC004069.1-201ENST00000504082 549 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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NFIAQ12857 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL590609.2-201ENST00000421430 368 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
NFIAQ12857 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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