Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC016556.1-201ENST00000510004 935 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR606-201ENST00000384851 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTPN12Q05209 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.9 ms