Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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PGGT1BP53609 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AP000462.2-203ENST00000540545 715 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PGGT1BP53609 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
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