Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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LHX9Q9NQ69 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AP000238.1-201ENST00000608759 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC090425.2-201ENST00000608818 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
LHX9Q9NQ69 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
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