Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP35-201ENST00000517210 151 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PNPLA4-203ENST00000444736 2752 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ATP5LP2-201ENST00000440646 311 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC092123.1-202ENST00000565310 405 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 NADK2-203ENST00000397338 3614 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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