Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 MYO5A-213ENST00000613858 12139 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPTN-201ENST00000316073 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB11FIP3-205ENST00000450428 3203 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MRVI1-209ENST00000531107 2887 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C14orf159-204ENST00000428926 2538 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 BHLHB9-202ENST00000372735 5130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SEC16A-205ENST00000371706 8093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR55-201ENST00000358337 4080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM63A-201ENST00000366835 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ARNT2-207ENST00000533983 6690 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GAREM1-201ENST00000269209 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DIO2-202ENST00000438257 6136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 KIAA1683-207ENST00000600359 3871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 UHRF1-207ENST00000624301 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM193A-202ENST00000382839 4710 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM255A-204ENST00000440464 3172 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LILRB4-204ENST00000391736 4002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC020658.3-201ENST00000568093 4028 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF658-206ENST00000621410 4025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RGS3-203ENST00000343817 3689 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CICP3-201ENST00000440782 2455 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 METTL13-201ENST00000361735 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 JMJD7-PLA2G4B-202ENST00000382448 3331 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026469.1-201ENST00000621095 3306 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 IGHV1-69-201ENST00000390633 412 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL080276.1-201ENST00000405959 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPL12P47-201ENST00000406185 127 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LIPC-203ENST00000414170 2968 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIAP29-201ENST00000414949 499 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC022748.1-201ENST00000434914 392 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL50P-201ENST00000461146 298 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL546P-201ENST00000479428 290 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097535.2-201ENST00000507715 142 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP003385.4-201ENST00000524977 324 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP4A26P-201ENST00000563017 196 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL049634.2-203ENST00000564763 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR4266-201ENST00000583300 55 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL462P-201ENST00000610302 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL422P-201ENST00000612850 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL343P-201ENST00000620904 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL640P-201ENST00000622591 261 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 5_8S_rRNA.5-201ENST00000638132 152 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HERC2P9-206ENST00000529624 5187 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NUMB-223ENST00000556772 5172 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCA17P-204ENST00000494925 3478 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AMBRA1-211ENST00000533727 4817 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB39-201ENST00000300101 6170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TSPAN14-206ENST00000372164 5476 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CNOT3-202ENST00000358389 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 M6PR-201ENST00000000412 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PCDHGA1-202ENST00000517417 4604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DIP2A-202ENST00000417564 6967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 RPS10-NUDT3-202ENST00000639725 4782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 TUBB8-204ENST00000564130 2438 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AC005906.2-201ENST00000640877 3408 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AP000997.2-201ENST00000564619 8400 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ1-201ENST00000357345 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNJ1-203ENST00000382499 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WWC1-209ENST00000521089 3562 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 HIF3A-204ENST00000300862 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 LIMCH1-202ENST00000381753 5705 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 CATSPERG-202ENST00000409235 3746 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 STAG3-218ENST00000615138 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 SP100-201ENST00000264052 3882 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 WDR44-202ENST00000371822 3877 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 AL031283.1-201ENST00000427824 5178 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 DUSP27-203ENST00000443333 4034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 PRDM10-201ENST00000304538 5817 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 GALNT15-201ENST00000339732 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
KRTAP4-12Q9BQ66 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.4 ms