Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC007342.9-201ENST00000623877 1385 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 STATH-208ENST00000615994 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
ZBED3Q96IU2 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112 ms