Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC47Q96A33 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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CCDC47Q96A33 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC47Q96A33 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CCDC47Q96A33 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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CCDC47Q96A33 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC47Q96A33 LINC02053-202ENST00000488262 940 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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