Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 CFHR4-201ENST00000251424 1292 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC011611.5-201ENST00000552477 578 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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UBR3Q6ZT12 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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UBR3Q6ZT12 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 DST-204ENST00000361203 22431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
UBR3Q6ZT12 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -2
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UBR3Q6ZT12 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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UBR3Q6ZT12 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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UBR3Q6ZT12 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
UBR3Q6ZT12 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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