Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNF111-206ENST00000559209 5278 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 IQCG-205ENST00000455191 1981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 USP9YP33-201ENST00000412220 421 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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ZNF239Q16600 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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ZNF239Q16600 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
ZNF239Q16600 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
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