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| FXN | Q16595 | RNU6-1314P-201 | ENST00000517139 | 104 nt | BASIC | 4.92 | □□□□□ -1.62 | | |
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| FXN | Q16595 | AC068831.8-201 | ENST00000620171 | 435 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | C1orf195-202 | ENST00000625027 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | SNAP23-222 | ENST00000626061 | 237 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | SNAP23-223 | ENST00000627440 | 210 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | UGT2B4-207 | ENST00000639621 | 1154 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | TET2-202 | ENST00000305737 | 9233 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | AHCTF1-201 | ENST00000326225 | 8633 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | RIMS2-205 | ENST00000436393 | 4384 nt | TSL 2 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | C5orf42-201 | ENST00000425232 | 11199 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | OR9H1P-201 | ENST00000446393 | 4888 nt | APPRIS P1 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | AL589740.1-207 | ENST00000607823 | 1962 nt | TSL 5 BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | MTND4P35-201 | ENST00000604257 | 1375 nt | BASIC | 4.91 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | PCDH9-203 | ENST00000456367 | 5072 nt | TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | PKHD1-202 | ENST00000371117 | 16282 nt | APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | SEC31A-209 | ENST00000500777 | 3610 nt | TSL 5 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | NDUFAF4-201 | ENST00000316149 | 2399 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | ACTR3BP5-201 | ENST00000448440 | 1479 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | CYP3A4-201 | ENST00000336411 | 2153 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | TRIQK-206 | ENST00000518748 | 3563 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.62 | | |
| FXN | Q16595 | SMIM11P1-201 | ENST00000369586 | 178 nt | BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FXN | Q16595 | DEFB119-203 | ENST00000376321 | 457 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |
| FXN | Q16595 | RFPL3S-202 | ENST00000382086 | 455 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 4.9 | □□□□□ -1.63 | | |