Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
HMGN3Q15651 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 ACTR6P1-201ENST00000514311 1104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HMGN3Q15651 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
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