Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 FAP-214ENST00000627638 2569 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.4□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
BRD3Q15059 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RPL23AP1-201ENST00000428990 471 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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BRD3Q15059 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
BRD3Q15059 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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