Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
SCARF1Q14162 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ZNF559-201ENST00000317221 2732 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPL34P20-201ENST00000442771 351 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 UBA52P3-201ENST00000491303 382 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
SCARF1Q14162 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
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