Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 OR6C2-203ENST00000641516 1682 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MIR5684-201ENST00000585074 65 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 KLRF1-202ENST00000354855 838 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
PDE1CQ14123 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
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