Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC234772.1-201ENST00000377927 937 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
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DDX39BQ13838 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
DDX39BQ13838 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
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