Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTCYBP16-201ENST00000509187 1129 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
RUNX3Q13761 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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RUNX3Q13761 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RUNX3Q13761 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RUNX3Q13761 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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RUNX3Q13761 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
RUNX3Q13761 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
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