Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL049779.2-201ENST00000553847 315 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC005911.1-201ENST00000619883 456 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 CDC42SE2-201ENST00000360515 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009127.1-201ENST00000467090 155 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC007599.2-201ENST00000573040 493 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
TOP3AQ13472 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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