Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC133794.1-201ENST00000602731 914 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TCEAL3-AS1-201ENST00000424887 361 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZBTB8OS-205ENST00000465588 548 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
SRSF5Q13243 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.6 ms