Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 MTCYBP14-201ENST00000457471 715 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC092185.1-201ENST00000491371 97 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 MACF1-204ENST00000372915 23440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AC110792.3-201ENST00000595906 1614 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
GRIN2BQ13224 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC009318.3-201ENST00000616916 503 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
GRIN2BQ13224 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms