Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
RESTQ13127 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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RESTQ13127 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RESTQ13127 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
RESTQ13127 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
RESTQ13127 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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