Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ASB17-201ENST00000284142 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
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IFT88Q13099 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
IFT88Q13099 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
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