Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 NECAB1-205ENST00000522820 811 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 LINC02520-201ENST00000570443 537 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IFFO1Q0D2I5 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.8 ms