Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AF107885.2-202ENST00000557653 448 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
HCN4Q9Y3Q4 CUBN-202ENST00000377833 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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HCN4Q9Y3Q4 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 RAB30-214ENST00000534141 3746 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 OR10R3P-201ENST00000361688 942 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
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