Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC107072.1-201ENST00000449007 110 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 BNC2-203ENST00000380672 12844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TRIM64-201ENST00000533122 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL591704.1-201ENST00000432574 275 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 CNOT4-205ENST00000423368 3297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00630-201ENST00000416381 2012 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AP002001.1-203ENST00000534002 267 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
TRIM35Q9UPQ4 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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