Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP35Q9P2H5 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP35Q9P2H5 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP35Q9P2H5 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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USP35Q9P2H5 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC5.72□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
USP35Q9P2H5 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
USP35Q9P2H5 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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